Bonsoir Hélène,
Tout d’abord, le JR Pass 7 jours équivaut au prix d’un a/r Tokyo-Kyoto. Si vous arrivez à condenser vos déplacement en Shinkansen sur ces 7 jours, ce sera plus que rentable.
Pour aller à Kanazawa, vous pouvez prendre le Shinkansen et donc utiliser votre JR Pass. Avec celui-ci, vous pouvez prendre n’importe quel Shinkansen sauf le Nozomi et le Mizuho, qui sont les trains les plus rapides. Pour aller à Kanazawa, c’est le Hokuriku Shinkansen, donc aucun souci.
Pour les quartiers dans Tokyo, les plus souvents cités sont Shinjuku, Shibyua et Asakusa/Uneo. Les trois ont leurs avantages et vous pouvez d’ailleurs les faire tous les trois si vous avez l’intention de changer d’endroit. Toutefois, j’ai une légère préférence pour celui d’Asakusa/Ueno. Pour se loger, c’est moins cher qu’à Shinjuku ou Shibuya.
Le quartier est assez populaire au bon sens du terme. On y trouve le grand sanctuaire Asakusa. J’aime bien me promener dans le marché Ameyoko ou alors dans la rue Kappabashi où il y a toutes sortes de boutiques d’ustensiles de cuisine (on peut même acheter les répliques de plats que les restaurants exposent en vitrine).
Vous êtes également proches du parc Ueno, où il y a le zoo (ça peut plaire aux enfants, je l’ai visité et il est très bien), quelques beaux sanctuaires et d’excellents musées, dont le musée national de Tokyo qui propose un très beau panorama des arts japonais et asiatiques).
Enfin, même s’il ne faut pas nécessairement choisir le quartier en fonction du trajet vers l’aéroport le dernier jour, Ueno dispose d’une liaison directe et rapide vers Narita (si c’est de là que vous parter, si c’est d’Haneda, le trajet est assez rapide aussi, avec la Yamanote depuis Ueno, puis le monorail). Si jamais vous choisissez de partir de Ueno avec le Keisei Skyliner, notez bien que celui-ci dispose d’une petite gare distincte de la grande gare de Ueno. Ce train est le plus cher pour Narita, mais le plus rapide. Il faut réserver son siège, soit à l’avance, soit sur place. Acheter son billet sur place peut vous éviter la crainte de louper votre train. Il y a un départ toutes les 20 minutes si je me souviens bien. Comme le Skyliner dispose de sa propre gare, c’est vraiment très rapide d’entrer, d’acheter son billet et de se rendre sur le quai.