Bonjour,
Le problème c’est qu’il y a beaucoup d’endroits auxquels on pourrait apposer l’étiquette “incontournable” en NZ. C’est donc d’abord en fonction de vos envies qu’un site sera plus incontournable qu’un autre.
La principale caractéristique du Mt Cook c’est que vous accédez facilement à un paysage composé de glaciers et de haut sommets. C’est vrai que vous allez voir différentes montagnes lors de votre itinéraire, mais elles seront de natures différentes :
Les montagnes de Fiordland (Milford Sound, Te Anau) sont plus arrondies et recouvertes de magnifiques forêts. Il y a des cascades impressionnantes, mais pas vraiment de glaciers (ou alors au lointain)Les montagnes du Mt Aspiring sont plus élevées et sont riches en glaciers. Cependant leur accès nécessite d’assez longues marches d’approche (pas de glaciers directement à proximité de Wanaka ou Queenstown).Les montagnes de la West Coast sont les mêmes que celles visibles depuis la région du Mt Cook, mais depuis l’autre versant. Comme c’est le versant humide les rochers sont recouverts d’une immense forêt et l’on n’aperçoit “que” la langue finale des glaciers Fox et Franz Josef (l’ambiance est totalement différente de celle du côté Mt Cook village)Les montagnes de l’Arthur Pass sont un peu moins élevées, mais très minérales. C’est encore un autre style de montagnes.En résumé, si les falaises recouvertes de glaciers vous intéressent c’est dans la région du Mt Cook que vous pourrez les approcher les plus facilement.
A noter que la région de Mc Kenzie (la région où se trouve le Mt Cook) propose également des lacs de toute beauté (Tekapo, Pukaki, etc.). C’est pour toutes ces raisons que les itinéraires privilégient plutôt cette région au détriment du Southland.
Cependant la péninsule d’Otago et les Catlins possèdent également des sites que l’on pourrait qualifier “d’incontournables”. Cette région est spécialement intéressante si l’observation des animaux est pour vous une priorité.
Le point faible de l’extrême sud c’est que l’itinéraire est plus long pour rejoindre Fiordland et que certaines parties de l’itinéraire sont d’un intérêt moindre : route en Christchurch et Dunedin et également la région d’Invercargill.
Pour finir avec Queenstown je dirais que la ville se trouve dans un site superbe et qu’il y a de magnifiques balades à faire dans les environs (en fait il y a de magnifiques balades partout en NZ). C’est également un des rares endroits où vous trouverez une activité à faire en cas de mauvais temps.
J’espère que j’ai réussi à vous aider dans vos choix (je n’en suis vraiment pas sûr 
Bon voyage
Pascal