De Milos à Amorgos sans changer de ferry Il y a effectivement Seajets qui va vous promener pendant 5 heures dans toutes les Cyclades en passant par Sifnos, Paros, Mykonos, Naxos, avec un de ses petits catamarans très inconfortables Superjet ou Superjet2 selon le jour.
Pour faire plus simple, moins vomitif, voire plus rapide et moins cher, sur ferryhopper, à l’affichage des résultats cliquez sur “Voir les trajets avec correspondance”
Vous pouvez aussi, au lieu de “Simple Voyage” séléctionner l’onglet “Tour des îles”
Entrez Milos en départ, par exemple Santorin en destination 1, et Amorgos tous ports en destination 2.
Et mettez la même date pour les deux voyages.
Je pense que ça revient au même que les trajets avec correspondance, mais c’est histoire de compliquer les choses. 
Merci pour votre réponse !
Le site est plutôt bien fait, mais je pense que ça reste compliqué et cher, je n’ai pas trouvé le trajet parfait 
Si vous préférez le calme Sifnos et Serifos pourraient plus le faire.
Paros et Naxos sont de grandes îles disposant d’un aéroport, ce qui fait qu’elles sont très prisées et les 2 les plus visitées des Cyclades après Santorin et Mykonos.
Cela dit coupler Amorgos avec Naxos est pas mal d’un point du vue diversité de style et liaisons ferries.
Il y a un bon réseau de bus à Naxos et question arrière pays voous aurez de quoi faire.
Milos du fait de son coté volcanique est plus proche des paysages lunaires que des plages de sable. La moitié de l’île (en gros tout le sud) est classée Natura2000 et n’est pratiquement pas habitée. Milos ayant aussi un aéroport elle a également pas mal la cote vis à vis des touristes qui ne veulent pas prendre de ferry. Si vous n’avez pas de voiture son réseau de bus n’est pas génial.
Sifnos a tout ce qu’il faut pour les randonnées avec des tas d’itinéraires bien balisés.
Il y a quelques villages sympa avec plage sur la cote sud. Kamares, le port, a aussi une plage sympa mais c’est pas encore tout à fait Sifnos à mon avis. La capitale Apollonia est chouette et est le hub avec sa voisine Artemonas d’un excellent réseau de bus qui vont un peu partout. L’ancienne capitale, Kastro est un concentré de cartes postales de village grec avec ses ruelles inaccessibles en voiture
Serifos est très montagneuse avec juste 2 ou 3 plages accessibles sans voiture et concentrées autour de Livadi, le port. Son réseau de bus est minimaliste. Vous pouvez randonner facilement le long de la cote mais pour le reste il faut aimer les forts dénivelés.
Cela dit je parle de bus mais il est évident qu’avec une voiture vous pourrez plus en profiter.
Je m’incruste dans la conversation pour avoir les informations parce que je prépare également un voyage dans les îles Grecques mais pour l’année prochaine 