Bonjour !
Je vous conseille de passer moins de jours à Tokyo et plus à Kyoto qui est vraiment super et bien-sûr Nara
De Tokyo vous pouvez aller à Kamakura qui est vraiment sympa aussi, une journée suffit, le métro y va si je me souviens bien.
A kyoto vous pouvez visiter le palais impérial, les touristes étrangers y sont prioritaires par rapport aux japonais qui doivent attendre des années !
Bon séjour !