Bonjour Aude,
Je pars avec mon compagnon pour un voyage de 3 semaines où nous souhaitons faire le Pérou et la Bolivie. Ok, beau projet 
J’aurais souhaité vos avis sur le parcours que nous prévoyons de faire. Réaliste? Voyons voir ça !
J1 - Vol Paris - Lima - Arequipa. Ok, faisable
Pour les vols internes je vous conseille de regarder sur les sites de LATAM, PERUVIAN ou encore LCPeru. Prevoyez pas mal de marge entre vos deux vols. Vaut mieux laisser le temps à l’imprevu 
J2- Arequipa - bus de nuit pour Puno. Ok, cela vous laisse peu de temps pour vous acclimater à l’altitude : Arequipa est à 2300 m et Puno à 3800 m. Vous ne pourrez pas non plus découvrir le Canyon du Colca.
Savez-vous déjà quelle compagnie allez-vous choisir pour vos bus ?
J3- Copacabana. Vous passez directement la frontière ? Le Lac Titicaca côté péruvien ne vous intéresse pas ?
J-4 Isla del sol. Ok.
J-5 Voyages vers Sucre. Ok, c’est assez long Copacabana — Sucre … Mais cela dit une très belle ville !
J-6 / 7 - Sucre puis bus de nuit pour Tupiza. Je ne suis pas sûre qu’il y ai une connexion directe entre Sucre et Tupiza … Il faudra surement passer par Potosi, qui vaut aussi le détour.
Pour cette partie il me semble que c’est beaucoup de trajet pour peu de temps … Peut-être vaudrait-il mieux enlever une étape. En une bonne journée il est possible de faire Copacabana - La Paz - Oruro - Potosi. Ensuite vous pouvez dormir une nuit à Potosi et enchaîner le lendemain sur Tupiza.
J-8 Tupiza. Ok. Si vous ne réservez pas un tour à l’avance pour découvrir le Sud de Lipez et le Salar il faudra prévoir un ou deux jours sur place car il faut trouver un groupe + une agence pour partir (au moins 5 ou 6 personnes).
J- 9/10/11/12 - Salar d’uyuni et sud lipez. Ok, vous allez en prendre plein les yeux.
Bus de nuit pour la Paz. Ok.
J-13 La Paz et bus pour Cuzco. Ok, un long trajet encore une fois …
J-14/15 Cuzco / Vallée Sacrée. Ok, plusieurs façons de visiter la vallée sacrée : avec une agence, avec un chauffeur de confiance ou par vos propres moyens en utilisant les transports publics. Dans votre cas comme le temps vous est compté je vous déconseille la dernière option.
J- 16 route pour le Machu picchu. Ok, en train, en bus ?
J17- Machu Picchu. 
J 18 /19 - Cuzco - Vallée Sacrée peut être la rainbow Mountain. Ok.
J- 20- Cuzco - Lima. Même remarque que pour votre vol Lima - Arequipa.
J-21 - Lima - Départ pour Paris. C’est bien de prévoir de dormir une nuit à Lima avant le vol international 
Par ailleurs, est ce que vous savez si Isla del sol est toujours coupée en deux? Les dernières infos que j’ai eu ne manifestaient malheureusement pas de changement de situation …
Ou peut-on accéder à toute l’ile ? Je ne crois pas !
Je vous remercie pour votre aide. Con mucho gusto.
Trois semaines pour le Pérou et la Bolivie c’est très peu, ce sont deux pays qui méritent un voyage chacun si vous voulez mon avis 
A très bientôt,
Serge