J’ai fais ce trajet pendant mes vacances l’an dernier et je confirme ce que tu dis.
Il y a 2 bus par jour direct Panama <> Bocas
1 le matin & 1 le soir.
Il est conseillé de reserver quelques jours avant le départ pour être sur d’avoir sa place dans le bus.
Pour réserver depuis Panama City il faut se rendre à la grande gare routière d’Albrook (collé au grand Mall) il y directement les guichets des companies de bus dans le terminal pour acheter le ticket.
Attention il vous faudra le passeport pour reserver et les places dans le bus sont numérotés.
Il y a en général 2 pauses repas / toilette de 15/30 minutes dans des endroits amménagés pour recevoir des foules de bus.
Vous arriverez ensuite au terminal d’Almirante qui est minuscule. Vous devrez prendre un taxi pour la gare des bateau à 5 minutes de voiture pour 1 $ / personne.
Après un taxi boat assez grand vous prendra pour 5/10 $ en fonction de la companie pour vous emmener sur l’ile de principale de Bocas. Si ce n’est pas votre destination finale, vous pourrez directement reprendre un taxi boat individuelle pour aller sur l’ile qui vous interesse entre 2 à 10 $
De mon coté au retour j’ai loupé le bateau pour retourner à Almirante. J’étais en panique car je ne savais pas si mon billet pourrais marcher le lendemain (car j’avais mon vol international à attraper) et au final avec un tour au comissariat (a coté du taxi boat) il explique que cela arrive régulièrement il faut juste l’expliquer en espagnol aux 3 étapes du trajet et cela fonctionne 
Enfin dernière info pratique, si les 8 heures de bus ne vous tente pas trop vous pouvez aussi faire Panama City > Davd et David > Bocas del toros en passant par les montagnes de Boquette qui sont chouettes.
N’'hésitez pas si vous avez des questions sur le pays