Avions

Plusieurs compagnies aériennes desservent le Honduras depuis la France et l’Amérique du Nord, proposant un vol avec une ou deux escales : Air France, British Airways, American Airlines, Continental Airlines, Delta. Il n'existe pour le moment aucun vol direct au départ de Paris.
La compagnie hondurienne Rollins Air figure depuis novembre 2011 sur la liste noire des compagnies interdites de vol dans l'Union européenne.
Le Honduras possède trois aéroports internationaux à Tegucigalpa, San Pedro Sula et Roatán.

Bus

Les bus sont globalement de bonne qualité au Honduras. Ils proposent des prix qui varient en fonction de leurs prestations (King Quality, Tica Bus, Hedman Alas, El Rey Express…). Les compagnies suivantes sont recommandées : Saenz, Viana et Hedma Alas.

Voitures, motos et vélos

Les voyageurs peuvent louer des voitures, des motos et des vélos sur place, mais attention ces véhicules ne sont pas autorisés à traverser les frontières.
Les routes sont dans un état médiocre, et la saison des pluies rend un peu plus difficile encore la circulation.
La conduite est un peu archaïque : prudence donc.
La signalisation et l'éclairage laissant à désirer, il est conseillé de ne pas rouler de nuit.

Bateaux

Les bateaux sont empruntés pour aller sur les îles des côtes pacifique et caraïbe, mais aussi dans la région de La Moskitia sur les rivières.