Itinéraire au Japon

Bonjour à tous,

J'ai effectué un petit périple de 3 semaines au Japon il y a 2 ans.
Périple qui m'a conduit aux endroits suivants :
Tokyo
Kamakura
Mont Fuji
Kyoto (Himeji & Arashiyama)
Okayama
Hiroshima (Miyajima)
Kobe

L'envie d'y retourner devenant de + en + pressante :) (3 semaines à nouveau) ... je m'interroge sur le planning le plus adéquat pour découvrir de nouvelles choses.

Je pense passer à nouveau quelques jours sur Tokyo mais pour le reste tout est ouvert.
J'ai lu qu'il pouvait être intéressant de découvrir les endroits suivants.

Nord : Sadogashima, Kakunodate, hirosaki, hokkaido
Sud : Nara & Osaka, Shikoku, Nagasaki, Okinawa

La dernière fois j'avais opté pour le JR pass de 3 semaines.
Je me demande s'il pourrait être intéressant de louer une voiture (pour une partie du séjour) afin de découvrir des endroits un peu plus typiques et pas forcément accessibles par train.
Concernant l'itinéraire j'aimerais un petit cocktail ville/nature (iles ?)/aspect traditionnel&typique du Japon.

Je vous remercie par avance de tous les conseils que vous pourrez me donner.
Arigato gozaimasu ! :)