itinéraire de 3 semaines au japon : qui dit mieux ?

Bonjour,
Je pars dans 10j au Japon avec mon mari, pour un périple de 3 semaines sur place en voiture. Les seules dates fixes sont Tokyo à l'arrivée (3 nuits) et au départ et Kyoto où on a réservé aussi un hotel pour profiter de la grande fête annuelle les 16-17 jt.
Entre ça, on est libres de bouger comme on veut, pour essayer d'avoir un aperçu des villes, sites historiques, campagnes, montagnes, plages...

Voilà un projet d'itinéraire (si certains peuvent nous conseiller des endroits où rester plus longtemps ou au contraire à éviter, je suis preneuse!) :
- Tokyo
- Nikko
- Alpes : nagano, Shirakawa, Takayama
- Kyoto
- Himeji
- Côte nord (Tottori) pour plage
- Ile de Miyajima (?)
- Shikoku
- Nara
- Péninsule d'Izu pour snorkeling
- Région des lacs et ascension du Fuji
- retour à Tokyo

Est-ce que ça vous paraît faisable sur 3 semaines ? Les temps de trajet en voiture sont-ils équivalents à ceux en France ?
Y-a-t-il des coins qu'il vaut mieux éviter et d'autres à rajouter au contraire ?
Où peut-on voir des rizières en terrasse sur ce parcours ?
Où peut-on trouver des jolies criques propices au snorkeling ?

Un grand Merci par avance pour votre aide et vos tuyaux divers et variés !

moab