JRPass oui - non...oui - non

Lisa,
Mon conseil est le suivant : faites le plan complet de votre voyage, regardez sur JR EXPEDIA pour choisir le meilleur trajet et savoir le coût respectif, faites la somme ... et comparez avec le prix du JRPass.
Sachez que sans résa, vous ne payez pas le reservation fee (mais ce n'est pas significatif - Y500 par billet) et quand vous montez sur le train vous devez chercher une place dans les NON RESERVED CARS (ils sont en général identifiés).
Si vous allez aussi prendre des bus, assurez-vous que le Pass couvre le bus prétendu.
D'autre part, même certains trains ne sont pas compris comme, par exemple, la ligne privée pour Nikko au départ d'Asakusa. Il y a bien sûr une option JR mais elle peut ne pas vous convenir.
D'autre part, si c'est vrai que JRPass peut être utilisé dans Tokyo (ligne Yamanote), à mon avis, le Metro est beaucoup plus convenable. Mais ça dépend où vous serez logée... et où vous voulez aller.
Si vous optez pour le Metro, achetez les billets (1 ou 2 jours) dès votre arrivée à l'aéroport de Narita où ils sont moins chers. Petite notice: le Metro de Tokyo ne comprend pas les lignes Toei (mais celles-ci ne sont pas nécessaires a priori).
En général, j'ai trouvé très facile d'acheter sur place les billets de metro et train (même si au début on est un peu perdu... en regardant toutes ces machines automatiques). Solution: cherchez la vente perso... Dans les grandes gares - Tokyo, Shinzuku, Kyoto - le personnel parle un peu l'anglais. Ailleurs, mes papiers du JR Expedia (avec la destination, le nom du train et l'horaire dessus ont été extrêmement utiles !!! Ajoutez quelques mots en japonais - suminasen, arigato -, des gestes et le sourire et tout ira bien.
Il n'y a aucune raison de paniquer: les japonais sont, en général, aimables et vous aideront à trouver votre chemin.
En résumé, nous n'avons pas acheté le JRPASS et effectivement ça a été la bonne option mais ça dépend bien sûr du voyage que vous voulez faire...