Nous avons voyagé trois semaines dans les Cyclades en septembre l'année dernière. Même en septembre, il y a une liaison quotidienne au moins entre Santorin et Amorgos par catamaran Vodaphone (liaison rapide donc), départ de Santorin autour de 20h et arrivée à Amorgos vers 21h30-22h. À noter que de Amorgos à Paros il y a un ferry BlueStar qui part à 6h45 de Katapola et arrive 3-4h plus tard à Parikia (idéal pour voir le soleil se lever derrière Amorgos!!!).
Côté logement, je ne connais pas Santorin, pour les autres, pas besoin de réserver, surtout à Amorgos où les loueurs viennent à l'arrivée du bateau et on peut négocier les tarifs. Dans les deux cas les adresses du Routard et du guide Hachette sont fiables. Je n'ai plus les noms de ceux dans lesquels nous avons séjourné, mais ils étaient dans l'un ou l'autre des deux guides et étaient vraiment très bien et pas chers (25-35 euro la chambre double pour la nuit)