je pense que pour visiter, le plus simple est de loger a fira car c'est central et pres des moyens de transport pour toute l'île. nous allons loger a l'hotel thira en septembre mais il y a moins cher comme la pension petros, san giorgio villas , galatias villas etc..voir le lien ci sessous
http://www.santorini.gr-santorini.com/hotels-in-santorini/fira-hotels1.htm
bonnes vacances