Le visa pour l'Indonésie n'est effectivement valable que deux mois. Il n'est renouvelable que si vous avez un visa de visite familiale ou culturelle. Dans ce cas, il faut être sponsorisé par un Indonésien résident en Indonésie qui se porte garant pour vous (généralement un responsable d'université pour les étudiants).
Sinon, pour avoir un nouveau visa, il faut partir à Singapour et reprendre un visa à l'ambassade d'Indonésie.
Pour rejoindre la Thaïlande, le mieux est de passer par la Malaisie en prenant un speedboat depuis Sumatra (Dumai-Malacca ou Medan-Penang) sinon depuis Jakarta à Singapour, mais c'est plus compliqué et moins confortable. Le plus facile est finalement de prendre les airs...
Si vous avez des difficultés, n'hésitez pas à me recontacter.